膜污染是指与膜接触的料液中微粒、胶体粒子或溶质大分子由于与膜发生物理、化学作用或因浓差化使某些溶质在膜表面浓度超过其溶解度及机械作用而引起的在膜面或膜孔内吸附、沉积造成膜孔径变小或堵塞，使膜通量与分离特性明显下降的不可逆变化现象。

一、微生物污染 

1）形成原因

微生物污染是指微生物在膜-水界面上积累，从而影响系统性能的现象。

这些微生物以反渗透膜为载体借助反渗透浓水段的营养盐而繁殖生长，在反渗透膜表面形成生物膜层，导致反渗透系统进出水间压差迅速增大，产水量与脱盐率快速下降，同时污染产品水。

微生物组成的生物膜可直接（通过酶作用）或间接（通过局部pH或还原电势作用）降解膜聚合物或其他反渗透单元组件，造成膜寿命缩短，使膜结构的完整性遭到破坏，甚至造成重大系统故障。

2）控制方法

生物污染可通过对进水进行连续或间歇的杀菌消毒来控制。对采自地表和浅层地下的原水应设置杀菌加药装置，投加氯类杀菌剂，投加量一般以进水余氯含量＞1mg／L为准。

三、悬浮颗粒物和胶体污染 
1）形成原因 
      悬浮颗粒和胶体是污堵反渗透膜的主要物质，也是造成出水SDI（污泥密度指数）超标的主要原因。
       由于水源及地域的不同，悬浮颗粒和胶体的成分也有较大的差异。通常没有受污染的地表水和浅层地下水的主要成分为：细菌、粘土、胶体硅、铁氧化物、腐殖酸产物以及预处理系统中人为过量投入的絮凝剂、助凝剂（如铁盐、铝盐等）等。
另外，原水中带正电荷的聚合物与反渗透系统中带负电的阻垢剂结合而形成沉淀，也是此类污染的成因之一。 
2）控制方法 
      原水中悬浮物含量＞70mg/L时，通常采用混凝、澄清、过滤的预处理方法；原水中悬浮物含量＜70mg/L时，通常采用混凝过滤的预处理方法；原水中悬浮物含量＜10mg/L时，通常采用直接过滤的预处理方法。